TP3 Analyse de réseaux biogéographiques

Avant de commencer le TP, je vais vous présenter une introduction à la biorégionalisation, ainsi que le contenu du TP.

 

3.1 Prise en main des données

Le package R bioregion met à disposition des données d’exemple d’abondance d’espèces végétales dans le sud de la France, fournies par le conservatoire botanique méditerranéen.

• vegemat : matrice de co-occurrences sites-espèces.
  
• vegesf : données spatiales associées.

Nous allons dans un premier temps calculer quelques statistiques de base pour explorer ces données.

Créez un script TP3.R et enregistrez-le dans votre répertoire de travail, que vous pouvez également nommer TP3.